Peptide Link

Mereka mewakili penyatuan dua atau lebih asam amino melalui hubungan antara yang asli dan peptida. Dalam produk dan protein, ikatan ini terkait dengan ikatan peptida dan hasil reaksi dari gugus karboksil, dengan gugus amino yang lain, dengan eliminasi molekul air.

Peptide Link

Ikatan peptida (-CO-NH-) biasanya direpresentasikan sebagai ikatan tunggal. Namun, ia memiliki serangkaian karakteristik yang membawanya lebih dekat ke ikatan rangkap. Karena nitrogen kurang elektronegatif daripada oksigen, ikatan CO memiliki 60% karakter ikatan rangkap sedangkan ikatan CN memiliki 40%. Oleh karena itu, ikatan CO dan NC dari ikatan peptida memiliki karakteristik antara antara ikatan tunggal dan ikatan rangkap. Faktanya, jarak interatomik yang diukur pada ikatan CO dan CN adalah perantara antara ikatan tunggal dan ganda. Susunan atom ini distabilkan oleh resonansi, sehingga keenam atom yang terlibat dalam pembentukan ikatan peptida terkandung dalam bidang yang sama.

Konsekuensi penting lain dari resonansi adalah bahwa ia meningkatkan polaritas ikatan peptida dan membentuk momen dipol (gambar kanan dalam tabel sebelumnya). Karena alasan ini, setiap ikatan peptida dapat berpartisipasi dalam dua ikatan hidrogen. Dalam salah satu dari mereka, gugus -NH- bertindak sebagai donor hidrogen dan yang lain, gugus -CO- bertindak sebagai reseptor hidrogen. Properti ini berkontribusi secara signifikan pada lipatan protein tiga dimensi, seperti yang akan kita lihat nanti.

Sifat parsial dari ikatan rangkap mencegah rotasi bebas ikatan yang bergabung dengan atom C dan N dalam ikatan peptida. Kekakuan ikatan rangkap ini membatasi kemungkinan konformasi peptida. Ada dua konfigurasi yang mungkin:

  • Konfigurasi cis: dua Ca berada di sisi yang sama dari ikatan rangkap.
  • Konfigurasi trans: dua Ca berada di sisi yang berbeda dari ikatan rangkap.

Perlu dicatat bahwa, secara umum, ikatan peptida direpresentasikan sebagai ikatan tunggal . Bagaimanapun, ia memiliki beberapa karakteristik yang membuatnya dekat dengan ikatan rangkap. Itulah sebabnya spesialis umumnya menyebutkan bahwa ikatan peptida memiliki sifat yang menempatkannya di tengah-tengah antara ikatan tunggal dan ikatan rangkap.

Direkomendasikan

Rabi
2020
Penghargaan
2020
Judul Oneroso
2020